Theo ông Lê Minh Khái, Phó tổng kiểm toán Nhà nước, trong giai đoạn 2005 - 2007, mặc dù hoạt động trong điều kiện nguồn dầu mỏ có xu hướng giảm (giảm từ 10.655.000 tấn năm 2005 xuống còn 8.703.000 tấn năm 2007), chi phí khai thác gia tăng... nhưng Vietsopetro vẫn hoàn thành vượt kế hoạch doanh thu, lợi nhuận (doanh thu trong 3 năm đạt 14 tỷ USD, lợi nhuận đạt 4 tỷ USD).

Kết quả kiểm toán trong năm vừa qua tại đơn vị này cho thấy, Vietsopetro đã tuân thủ đầy đủ các văn bản pháp lý, đáp ứng yêu cầu quản lý, cơ bản trích nộp đầy đủ và kịp thời các khoản thuế, lợi nhuận được chia vào ngân sách nhà nước Việt Nam (các khoản thuế nộp vào ngân sách là 7.547.000.000 USD, lợi nhuận chia cho phía Việt Nam là 2.216.000.000 USD, phía Nga là 2.289.000.000 USD).

Tuy nhiên, theo ông Khái, qua kiểm toán, cơ quan này đã phát hiện một số sai sót trong kê khai, hạch toán và đã kiến nghị nộp các khoản thuế tăng thêm và ngân sách nhà nước là 11,9 triệu USD.

Ngoài việc kiến nghị tăng thu khoản thuế trên, Kiểm toán Nhà nước cũng đề nghị Chính phủ chỉ đạo các cơ quan chức năng thực hiện các thủ tục để hoàn trả 17.900.000 USD thuế xuất khẩu cho Liên bang Nga phần lợi nhuận chia bổ sung trong các năm 2005 - 2007 của Vietsopetro.